21–22 июня 2006 года Военно-исторический музей принял участие в масштабной памятной программе, организованной Префектурой Центрального административного округа Москвы и Управой района Якиманка. Мероприятия были приурочены к 65-й годовщине начала Великой Отечественной войны и нападения нацистской Германии на СССР.
В рамках мемориальной акции в ночь на 22 июня музей был открыт для особых гостей. В эти скорбные часы памятную экспозицию посетили более 150 ветеранов войны.